吴崑老师主要研究产业经济与电子商务领域，在专业建设、教学、科研上做出了较为突出成绩，他作为北京财贸职业学院商学院连锁经营管理与电子商务专业负责人，在与专业教师共同努力下，连锁经营管理专业被评为国家示范校重点建设专业，电子商务专业被评为北京市示范专业，并顺利通过了验收；主持的《菜百黄金订单班人才培养模式教学改革》获北京市教学成果二等奖；作为主要参与人参与课题《高职财经商贸类专业上班式课程体系研究与实践》，获北京市教学成果一等奖与国家教学成果二等奖，主持的电子商务与连锁经营管理专业创新团队被评为北京市教学团队；主持建设电子商务专业实训基地作为学院商业技能实训基地的一部分被评为北京市示范性实训基地。其主持的北京市社会科学研究课题《连锁店长胜任能力的培养途径与机制的研究》课题，被中国连锁经营协会采用，在此基础上，建立了品类管理师的1+X资格认证体系，在全国进行推广；主持的《连锁经营管理师》国家职业技能标准已经在人力与社会保障部颁布执行，在教研与科研方面，吴崑老师能够把握学科方向与学科前沿，应用研究的成果较多，共计撰写专著一本，主编教材三本（全部评委教育部十一五与十二五规划教材），公开发表学术论文三十篇，编写的教材与论文七十余万字，作为课题组长，主持与申报了二项北京市教育委员会人文社会科学研究课题，北京市商委与发改委课题各一项，企业横向课题多项，作为子课题负责人，完成教育部重点课题一项，目前已经结题，其研究成果已经被相关专业与企业采纳，并取得了一定的成果，由于科研与教学成果突出，吴崑老师于2006年被授予北京市优秀教师的称号，2010年被授予北京市高校教学名师称号。